Так, как скрипт (например: http://www.wox.su/site/1.js), подключается последним в теле страницы, т.е так: <!DOCTYPE html> <html> <head> ... </head> <body> ... <script src="//www.wox.su/site/1.js">Включай обработку JavaScript, буду рекламу показывать!</script> </body> </html>
Нужно написать скрипт, который выполнится и этим подключит другой скрипт, но уже после скрипта с кликандером, в тот скрипт следует поместить код, который переопределит код функции, описанной в скрипте с кликандером.