PDO это драйвер MySQL, а не какая то особенная библиотека. Как и для MySQL там требуется соединение с базой, тот же логин, пароль и пользователь. А если у тебя в скрипте 2 подключения, тогда выкинь свой скрипт. На бегемот драйвер pdo отлично работает.