Mobiman, scratch - редактор схем. В теории, нодовый редактор можно представить схемами и обратно. Поэтому если захочешь свой редактор блупринтов - вперёд
Хотя с первого взгляда программы и кажутся монолитными и самодостаточными, это не так. Любую программу на NodeStudio можно использовать в обычном PHP коде, любой PHP код можно использовать в программе на NodeStudio, и любую программу на NodeStudio можно использовать в другой программе на NodeStudio.
Как это работает? Каждая программа экспортирует функцию, которую другая программа или PHP скрипт может вызвать. В компиляторе предусмотрен механизм инклудов, позволяющий статически слинковать две программы на NodeStudio и использовать один независимо от другого.